Atlas of Schistosoma mansoni long non-coding RNAs and their expression correlation to protein-coding genes

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dc.contributorLaboratório de Expressão Gênica em Eucariotospt_BR
dc.contributorLab. Parasitologiapt_BR
dc.contributor.authorVasconcelos, Elton José Rosas dept_BR
dc.contributor.authorMesel, Vinicius Carqueijopt_BR
dc.contributor.authorSilva, Lucas Ferreira dapt_BR
dc.contributor.authorPires, David da Silvapt_BR
dc.contributor.authorLavezzo, Guilherme Miurapt_BR
dc.contributor.authorPereira, Adriana da Silva Andradept_BR
dc.contributor.authorAmaral, Murilo Senapt_BR
dc.contributor.authorVerjovski-Almeida, Sergiopt_BR
dc.date.accessioned2020-07-09T21:21:00Z-
dc.date.available2020-07-09T21:21:00Z-
dc.date.issued2018pt_BR
dc.identifier.citationVasconcelos EJR, Mesel VC, Silva LF, Pires DS, Lavezzo GM, Pereira ASA, et al. Atlas of Schistosoma mansoni long non-coding RNAs and their expression correlation to protein-coding genes. Database. 2018 Jan;2018:bay068. doi:10.1093/database/bay068.pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.butantan.gov.br/handle/butantan/2537-
dc.description.abstractLong non-coding RNAs (lncRNAs) have been widely discovered in several organisms with the help of high-throughput RNA sequencing. LncRNAs are over 200 nt-long transcripts that do not have protein-coding (PC) potential, having been reported in model organisms to act mainly on the overall control of PC gene expression. Little is known about the functionality of lncRNAs in evolutionarily ancient non-model metazoan organisms, like Schistosoma mansoni, the parasite that causes schistosomiasis, one of the most prevalent infectious-parasitic diseases worldwide. In a recent transcriptomics effort, we identified thousands of S. mansoni lncRNAs predicted to be functional along the course of parasite development. Here, we present an online catalog of each of the S. mansoni lncRNAs whose expression is correlated to PC genes along the parasite lifecycle, which can be conveniently browsed and downloaded through a new web resource http://verjolab.usp.br. We also provide access now to navigation on the co-expression networks disclosed in our previous publication, where we correlated mRNAs and lncRNAs transcriptional patterns across five life-cycle stages/forms, pinpointing biological processes where lncRNAs might act upon.pt_BR
dc.description.sponsorshipEuropean Union’s Seventh Framework Programmept_BR
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)pt_BR
dc.description.sponsorshipConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)pt_BR
dc.description.sponsorshipFundação Butantanpt_BR
dc.format.extentbay068pt_BR
dc.language.isoEnglishpt_BR
dc.relation.ispartofDatabase: The Journal of Biological Databases and Curationpt_BR
dc.rightsOpen Accesspt_BR
dc.titleAtlas of Schistosoma mansoni long non-coding RNAs and their expression correlation to protein-coding genespt_BR
dc.typeArticlept_BR
dc.identifier.doi10.1093/database/bay068pt_BR
dc.identifier.urlhttp://dx.doi.org/10.1093/database/bay068pt_BR
dc.contributor.externalUniversidade de São Paulo (USP)¦¦Brasilpt_BR
dc.contributor.externalWestern University of Health Sciences (WesternU)¦¦Estados Unidospt_BR
dc.identifier.citationvolume2018pt_BR
dc.relation.ispartofabbreviatedDatabasept_BR
dc.identifier.citationabntv. 2018, bay068, jan. 2018pt_BR
dc.identifier.citationvancouver2018 Jan;2018:bay068pt_BR
dc.contributor.butantanVasconcelos, Elton José Rosas de|:Aluno|:Laboratório de Expressão Gênica em Eucariotos|:PrimeiroAutor:Autor de correspondênciapt_BR
dc.contributor.butantanMesel, Vinícius Carqueijo|:Aluno|:Lab. Parasitologia:Laboratório de Expressão Gênica em Eucariotos|:pt_BR
dc.contributor.butantanSilva, Lucas Ferreira da|:Aluno|:Laboratório de Expressão Gênica em Eucariotos:Lab. Parasitologia|:pt_BR
dc.contributor.butantanPires, David da Silva|:Técnico|:Laboratório de Expressão Gênica em Eucariotos:Lab. Parasitologia|:pt_BR
dc.contributor.butantanLavezzo, Guilherme Miura|:Aluno|:Lab. Parasitologia:Laboratório de Expressão Gênica em Eucariotos|:pt_BR
dc.contributor.butantanPereira, Adriana da Silva Andrade|:Aluno|:Laboratório de Expressão Gênica em Eucariotos:Lab. Parasitologia|:pt_BR
dc.contributor.butantanAmaral, Murilo Sena|:Técnico|:Lab. Parasitologia:Laboratório de Expressão Gênica em Eucariotos|:pt_BR
dc.contributor.butantanVerjovski-Almeida, Sergio|:Pesquisador|:Lab. Parasitologia:Laboratório de Expressão Gênica em Eucariotos|:pt_BR
dc.sponsorship.butantanConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)¦¦pt_BR
dc.sponsorship.butantanEuropean Union's Seventh Framework Programme¦¦602080pt_BR
dc.sponsorship.butantanFundação Butantan¦¦pt_BR
dc.sponsorship.butantanFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)¦¦2014/24560-8pt_BR
dc.sponsorship.butantanFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)¦¦2016/10046-6pt_BR
dc.identifier.bvsccBR78.1pt_BR
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dc.description.dbindexedYespt_BR
item.openairetypeArticle-
item.fulltextCom Texto completo-
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item.languageiso639-1English-
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