Análise do sistema toxina-antitoxina tipo II na fisiologia bacteriana de uma cepa híbrida: Escherichia coli enteropatogênica atípica e E. coli extraintestinal


Publication type
Master thesis
Language
Portuguese
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Abstract
The toxin-antitoxin (TA) systems are genetic modules associated with some bacterial processes, such as cell formation persistence, biofilm formation, protection against bacteriophages and responses to stressful environments. In these systems, the toxin is related to the inhibition of physiological processes and the antitoxin provides protection to the cell against the toxin. Five TA type II systems present in the genome of the hybrid strain BA1250 (atypical enteropathogenic E. coli and extraintestinal E. coli strain) were analyzed. The hybrid strain BA1250 can colonize different host niches and can face different stress environments, therefore, through transcription analysis under stress conditions such as nutritional, oxidative, osmotic and acid, the CcdB-CcdA, YhaV-PrlF, MazF-MazE, YoeB-YefM and PasI-PasT were evaluated both in the log and stationary phases of BA1250 strain. We observed significant differences in the expression levels of the CcdB-CcdA, YhaV-PrlF, YoeB-YefM and PasT-PasI systems in the presence of nutritional stress in the stationary phase. In acid stress, an increase in the gene expression of YhaV, YefM and PasT toxins in stationary phase was observed. In contrast, the analysis of the MazF-MazE system did not show any change in expression levels under the stress conditions evaluated. These data indicate that these four TA systems seem to be involved in the stress response of the BA1250 strain, therefore involved in the physiological processes of BA1250.
Abstract in Portuguese
Os sistemas toxina-antitoxina (TA) são módulos genéticos que estão associados a alguns processos das bactérias, como formação de células persistentes, formação de biofilme, proteção contra bacteriófagos e respostas a ambientes estressantes. Nesses sistemas, a toxina está relacionada à inibição de processos fisiológicos e a antitoxina fornece proteção à célula contra a toxina. Cinco sistemas TA tipo II presentes no genoma da cepa híbrida BA1250 (E. coli enteropatogênica atípica e cepa de E. coli extraintestinal) foram analisados. A cepa híbrida BA1250 pode colonizar diferentes nichos do hospedeiro e pode enfrentar diferentes ambientes de estresse, por tanto, por meio de análises de transcrição sob condições de estresse como nutricional, oxidativo, osmótico e ácido, os sistemas CcdB-CcdA, YhaV-PrlF, MazF-MazE, YoeB-YefM e PasI-PasT foram avaliados tanto na fase log quanto estacionária do cultivo da cepa BA1250. Observamos diferenças significativas nos níveis de expressão dos sistemas CcdB-CcdA, YhaV-PrlF, YoeB-YefM e PasT-PasI na presença de estresse nutricional na fase estacionária. No estresse ácido foi observado um aumento de expressão gênica das toxinas YhaV, YefM e PasT em fase estacionária. Em contraste, a análise do sistema MazF-MazE não apresentou nenhuma alteração nos níveis de expressão nas condições de estresse avaliadas. Esses dados indicam que esses quatro sistemas TA parecem estar envolvidos na resposta ao estresse da cepa BA1250, portanto envolvidos em processos fisiológicos da BA1250.
Reference
SILVA, Jessika Cristina Alves da. Análise do sistema toxina-antitoxina tipo II na fisiologia bacteriana de uma cepa híbrida: Escherichia coli enteropatogênica atípica e E. coli extraintestinal. 2022. 86 f. Dissertação (Mestrado em Ciências - Toxinologia), Instituto Butantan, São Paulo, 2022.
Link to cite this reference
https://repositorio.butantan.gov.br/handle/butantan/4742
Issue Date
2022

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